Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NGFRP08138 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NGFRP08138 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NGFRP08138 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
NGFRP08138 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NGFRP08138 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms