Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSF1RP07333 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF1RP07333 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms