Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CBX7O95931 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX7O95931 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX7O95931 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CBX7O95931 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX7O95931 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX7O95931 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX7O95931 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms