Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPFIA4O75335 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPFIA4O75335 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms