Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDM4AO75164 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDM4AO75164 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms