Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGSF3O75054 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGSF3O75054 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms