Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP104O60308 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP104O60308 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP104O60308 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP104O60308 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP104O60308 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CEP104O60308 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CEP104O60308 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CEP104O60308 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP104O60308 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP104O60308 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP104O60308 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP104O60308 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP104O60308 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP104O60308 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP104O60308 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP104O60308 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CEP104O60308 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP104O60308 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP104O60308 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP104O60308 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP104O60308 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP104O60308 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP104O60308 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CEP104O60308 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CEP104O60308 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP104O60308 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP104O60308 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP104O60308 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP104O60308 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP104O60308 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CEP104O60308 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms