Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAK2O60296 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAK2O60296 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms