Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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PDE6DO43924 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PDE6DO43924 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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