Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDIL3O43854 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDIL3O43854 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms