Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRKAB2O43741 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRKAB2O43741 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms