Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMP2AO43633 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms