Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FOXO3O43524 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FOXO3O43524 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms