Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRPF3O43395 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRPF3O43395 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms