Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCP110O43303 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCP110O43303 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCP110O43303 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCP110O43303 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCP110O43303 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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