Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SIAH2O43255 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SIAH2O43255 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms