Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN3O15551 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN3O15551 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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