Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MCF2LO15068 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MCF2LO15068 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms