Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHOX2AO14813 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHOX2AO14813 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHOX2AO14813 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms