Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PIK3CDO00329 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms