Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TULP1O00294 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TULP1O00294 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TULP1O00294 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TULP1O00294 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TULP1O00294 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TULP1O00294 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TULP1O00294 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TULP1O00294 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TULP1O00294 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TULP1O00294 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TULP1O00294 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TULP1O00294 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TULP1O00294 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TULP1O00294 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TULP1O00294 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TULP1O00294 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TULP1O00294 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TULP1O00294 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TULP1O00294 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TULP1O00294 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TULP1O00294 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TULP1O00294 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TULP1O00294 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms