Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIP1O00291 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIP1O00291 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIP1O00291 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIP1O00291 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HIP1O00291 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIP1O00291 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HIP1O00291 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HIP1O00291 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HIP1O00291 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIP1O00291 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIP1O00291 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIP1O00291 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIP1O00291 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HIP1O00291 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIP1O00291 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIP1O00291 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIP1O00291 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIP1O00291 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIP1O00291 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HIP1O00291 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HIP1O00291 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HIP1O00291 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms