Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNAP23O00161 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP23O00161 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms