Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QQQ9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QQQ9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QQQ9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QQQ9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QQQ9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
J3QQQ9 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
J3QQQ9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms