Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PATL2C9JE40 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PATL2C9JE40 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms