Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00587B1AMM8 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00587B1AMM8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms