Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SRRM4A7MD48 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SRRM4A7MD48 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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