Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms