Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PCNX2A6NKB5 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms