Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LIPT2A6NK58 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms