Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SERINC4A6NH21 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SERINC4A6NH21 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms