Protein–RNA interactions for Protein: A6NFN3

RBFOX3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX3A6NFN3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBFOX3A6NFN3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RBFOX3A6NFN3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms