Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GOLGA6L4A6NEF3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GOLGA6L4A6NEF3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms