Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CFAP69A5D8W1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP69A5D8W1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP69A5D8W1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP69A5D8W1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CFAP69A5D8W1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP69A5D8W1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP69A5D8W1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP69A5D8W1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CFAP69A5D8W1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms