Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF22A3QJZ6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PRAMEF22A3QJZ6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms