Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FRMD3A2A2Y4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms