Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQD8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQD8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A0A1W2PQD8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A0A1W2PQD8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms