Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP483-201ENST00000363431 118 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP50-201ENST00000364694 315 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC109638.1-201ENST00000417406 326 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 FDPSP8-201ENST00000438304 1089 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC231532.1-201ENST00000438584 312 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL91P-201ENST00000469313 291 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC018816.1-206ENST00000474544 455 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC018639.1-201ENST00000492994 442 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC122710.2-201ENST00000506093 596 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC083973.1-201ENST00000523459 590 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 NPIPP1-203ENST00000547107 1071 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC015802.4-202ENST00000591967 474 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SPRR5-201ENST00000636302 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 NPIPB4-203ENST00000415645 3606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC087203.2-201ENST00000526502 1587 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 EVI2A-203ENST00000462804 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 CSNK1G1-202ENST00000561349 1756 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD46-201ENST00000364043 104 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf92-202ENST00000380685 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 MIR181C-201ENST00000384881 110 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A11-205ENST00000403208 564 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC016716.2-201ENST00000418621 486 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SYNJ2-IT1-201ENST00000442328 599 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 OR51P1P-201ENST00000447547 942 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL213P-201ENST00000463482 317 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P17-201ENST00000470927 724 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TIMMDC1Q9NPL8 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.1 ms