Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 NIN-204ENST00000382043 4216 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RBBP4-202ENST00000373493 7943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 USP50-203ENST00000532404 1386 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC104463.2-201ENST00000428573 314 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC092106.2-201ENST00000436597 487 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AC092164.1-201ENST00000452212 726 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
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ECM1Q16610 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 ERBB4-205ENST00000436443 12084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 NFX1-203ENST00000379540 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
ECM1Q16610 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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