Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
ZNF56Q15929 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.6 ms