Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PCBP1-AS1-230ENST00000439670 2180 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OSBPL9-203ENST00000428468 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC010478.1-201ENST00000601500 6762 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TANC1-201ENST00000263635 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 THSD7A-202ENST00000423059 10663 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR5B12-201ENST00000302572 1054 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 KCNB1-201ENST00000371741 11879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 HSD17B13-201ENST00000302219 2269 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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HERC1Q15751 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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HERC1Q15751 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NLGN4X-204ENST00000381095 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 TECPR2-201ENST00000359520 8686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 FTH1P10-202ENST00000430907 550 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CASC6-201ENST00000437768 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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HERC1Q15751 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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HERC1Q15751 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 ARHGAP19-202ENST00000358531 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 CIT-201ENST00000261833 8578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
HERC1Q15751 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
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