Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC018442.2-201ENST00000523658 648 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SCN1A-204ENST00000423058 8191 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 TMC3-AS1-206ENST00000612811 2726 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL160408.3-201ENST00000442382 3564 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CDHR3-201ENST00000317716 3813 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 TCF12-213ENST00000559703 1544 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL050335.1-201ENST00000396909 869 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 FABP5P1-201ENST00000423401 411 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 TVP23CP1-201ENST00000450317 639 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC022784.1-201ENST00000512942 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LACTB2-AS1-203ENST00000518553 817 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SSPNQ14714 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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