Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 THBS3-201ENST00000368378 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 OR7A17-203ENST00000642123 3565 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TNPO3-202ENST00000471166 3019 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CLK1-201ENST00000321356 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AF121898.1-201ENST00000440763 1860 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MTERF4-222ENST00000614476 4524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 KCNMA1-273ENST00000639913 12071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CUL4B-201ENST00000336592 3109 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 INTS7-204ENST00000440600 3136 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CD180-201ENST00000256447 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LGALS17A-201ENST00000412609 2562 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SLC3A1-204ENST00000409380 2424 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ZNF763-202ENST00000358987 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 PIWIL3-201ENST00000332271 3504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 BRCC3-203ENST00000369459 2641 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 NR1I2-203ENST00000466380 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 PPFIBP1-207ENST00000537927 5719 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ZNF441-201ENST00000357901 4356 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ARMC3-201ENST00000298032 2811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RAB27A-202ENST00000396307 3459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RBFOX1-203ENST00000355637 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC125232.1-201ENST00000452554 1408 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 KCNAB1-202ENST00000389634 1119 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
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MKRN3Q13064 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC021001.1-201ENST00000518703 987 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 pRNA.9-201ENST00000618609 89 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC093909.6-201ENST00000624757 775 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC091953.4-201ENST00000625179 341 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ZNF169-203ENST00000480716 2716 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SLFN11-202ENST00000394566 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC090771.1-201ENST00000585803 1618 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CXCR6-201ENST00000304552 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 PLPPR1-202ENST00000395056 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 GBA3-203ENST00000508166 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 NDUFA9-201ENST00000266544 8363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LDB3-201ENST00000263066 3873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AP003972.1-201ENST00000625192 5446 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC005538.2-201ENST00000623215 1864 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 NUSAP1-210ENST00000560177 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC009053.1-202ENST00000563377 2051 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ENOX2-207ENST00000610637 2422 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RTN3-202ENST00000339997 4886 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC013444.1-201ENST00000428909 1904 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ZNF544-201ENST00000269829 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RBPJP6-201ENST00000411556 1431 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SLC9A6-213ENST00000637234 4691 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 OR10A3-201ENST00000360759 1061 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MS4A3-203ENST00000395032 867 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RPL21P107-201ENST00000411449 460 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
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