Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL157938.2-202ENST00000588378 875 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL022237.1-201ENST00000446663 358 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
FOXD4Q12950 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms