| FOXD4 | Q12950 | ZRSR2-202 | ENST00000380308 | 744 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | CAV1-204 | ENST00000393470 | 598 nt | TSL 4 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | YWHAZP6-201 | ENST00000399764 | 738 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | SULT6B1-201 | ENST00000407963 | 902 nt | TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | SNORA77.2-201 | ENST00000408571 | 112 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AP000357.1-201 | ENST00000409926 | 1165 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | KCNJ13-203 | ENST00000410029 | 1177 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC099566.1-204 | ENST00000413825 | 943 nt | TSL 3 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | PLCE1-AS2-201 | ENST00000419353 | 459 nt | TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC117944.1-201 | ENST00000430748 | 641 nt | TSL 3 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC00595-203 | ENST00000432742 | 683 nt | TSL 3 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL450384.1-201 | ENST00000433526 | 413 nt | TSL 2 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC00383-201 | ENST00000433664 | 817 nt | TSL 3 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MIR205HG-206 | ENST00000440276 | 539 nt | TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC079763.1-201 | ENST00000441295 | 738 nt | TSL 3 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC005518.1-201 | ENST00000448131 | 1116 nt | TSL 2 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | GAPDHP14-201 | ENST00000450472 | 937 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MTND2P8-201 | ENST00000450555 | 1025 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC01072-201 | ENST00000455848 | 431 nt | TSL 3 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC092958.2-201 | ENST00000476987 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC02114-201 | ENST00000503757 | 801 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | CSN1S1-203 | ENST00000507763 | 597 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RN7SKP67-201 | ENST00000515905 | 235 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC018607.1-201 | ENST00000518552 | 673 nt | TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | COX6B1P4-201 | ENST00000519826 | 484 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC023202.1-201 | ENST00000521681 | 491 nt | TSL 3 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MAL2-201 | ENST00000522112 | 573 nt | TSL 4 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LECT2-205 | ENST00000522943 | 574 nt | TSL 3 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC113423.1-201 | ENST00000523279 | 289 nt | TSL 3 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AP003031.2-202 | ENST00000533590 | 572 nt | TSL 4 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | NPIPB1P-201 | ENST00000547442 | 1129 nt | TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC079950.1-201 | ENST00000551229 | 568 nt | TSL 4 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC090502.3-201 | ENST00000552046 | 529 nt | TSL 3 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RAB27A-212 | ENST00000569493 | 1013 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ANKRD20A5P-203 | ENST00000580200 | 566 nt | TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC005544.1-201 | ENST00000584277 | 460 nt | TSL 3 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | NF1P5-201 | ENST00000588287 | 448 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL157938.2-202 | ENST00000588378 | 875 nt | TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ZNF92P3-201 | ENST00000596594 | 954 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ABI1P1-201 | ENST00000603375 | 1120 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC006924.1-201 | ENST00000610750 | 559 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | SMR3B-204 | ENST00000614072 | 783 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MIR6886-201 | ENST00000619864 | 61 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LGI1-209 | ENST00000627699 | 664 nt | TSL 3 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC116667.2-201 | ENST00000641075 | 823 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | OR2L1P-202 | ENST00000641567 | 1023 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | CACNB4-221 | ENST00000636130 | 7748 nt | TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC092821.1-201 | ENST00000640129 | 4180 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ERMN-201 | ENST00000397283 | 3760 nt | TSL 2 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | CASC19-260 | ENST00000641828 | 2001 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | SLC26A7-210 | ENST00000617233 | 5257 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | NKIRAS1-209 | ENST00000614374 | 1612 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC005702.3-201 | ENST00000585345 | 1447 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC024587.1-201 | ENST00000505925 | 2157 nt | BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | TCF4-281 | ENST00000636822 | 7640 nt | TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ZNF337-202 | ENST00000376436 | 3613 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | KMT2D-201 | ENST00000301067 | 19419 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | CDC42SE2-201 | ENST00000360515 | 3591 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | PIH1D3-203 | ENST00000535523 | 1926 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.8 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ZC3H12C-201 | ENST00000278590 | 8807 nt | TSL 2 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AGO2-201 | ENST00000220592 | 14581 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | GIF-201 | ENST00000257248 | 1518 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL031119.1-201 | ENST00000404707 | 1879 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC01541-202 | ENST00000568095 | 3105 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | C1orf140-202 | ENST00000439004 | 4340 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RYR3-212 | ENST00000634891 | 15591 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | SULF1-204 | ENST00000458141 | 5551 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | UPRT-207 | ENST00000530743 | 1636 nt | TSL 2 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | METTL21EP-201 | ENST00000298105 | 713 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ZNF28-201 | ENST00000339844 | 650 nt | TSL 4 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RN7SKP275-201 | ENST00000364626 | 301 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | HMGB1P13-201 | ENST00000406019 | 642 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC092687.1-201 | ENST00000418835 | 389 nt | TSL 3 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | VN1R20P-201 | ENST00000425215 | 966 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC00266-4P-201 | ENST00000427373 | 842 nt | TSL 3 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ATP13A4-AS1-202 | ENST00000431512 | 394 nt | TSL 3 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RPL39L-202 | ENST00000433055 | 749 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL035458.1-201 | ENST00000433096 | 585 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ARPP21-218 | ENST00000438071 | 1103 nt | TSL 3 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AP000281.1-201 | ENST00000444036 | 316 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL022237.1-201 | ENST00000446663 | 358 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC008080.2-201 | ENST00000455149 | 577 nt | TSL 4 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC112187.1-201 | ENST00000455837 | 479 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC006947.1-201 | ENST00000457168 | 484 nt | TSL 3 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC104687.1-201 | ENST00000485829 | 412 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | PDCD10-216 | ENST00000492396 | 814 nt | TSL 5 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC023050.1-201 | ENST00000498198 | 304 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC091868.2-201 | ENST00000506717 | 556 nt | TSL 3 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC106872.4-201 | ENST00000510050 | 523 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC01088-208 | ENST00000511895 | 795 nt | TSL 2 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC008957.1-202 | ENST00000512329 | 681 nt | TSL 3 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC246817.2-206 | ENST00000520570 | 582 nt | TSL 4 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC062004.1-202 | ENST00000524014 | 246 nt | TSL 5 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC021269.1-201 | ENST00000526860 | 705 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC010768.4-201 | ENST00000528183 | 520 nt | TSL 3 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL133481.2-201 | ENST00000538322 | 367 nt | TSL 2 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC02420-201 | ENST00000543387 | 741 nt | TSL 5 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | POLR2KP1-201 | ENST00000553226 | 168 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC023968.1-201 | ENST00000560719 | 475 nt | BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC119868.1-202 | ENST00000584741 | 347 nt | TSL 2 BASIC | 5.79 | □□□□□ -1.48 | | |