Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 LINC01291-203ENST00000435984 565 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 ATF7IP-222ENST00000544627 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 DLC1-215ENST00000520226 3556 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 MORF4L2-206ENST00000433176 1965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 ZNF449-201ENST00000339249 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 RNU1-55P-201ENST00000365510 158 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
USP17L18D6R9N7 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms