Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CNGB1Q14028 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms