Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CUL1Q13616 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
CUL1Q13616 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
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