Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
CHAF1BQ13112 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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