Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CKAP2-203ENST00000378037 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RXFP1-207ENST00000470033 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC007938.1-201ENST00000562524 2902 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AASS-203ENST00000417368 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TMEM217-202ENST00000356757 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 THAP12P1-201ENST00000398672 2203 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MSH5-205ENST00000395853 2704 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TMPRSS4-219ENST00000616579 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC011447.3-202ENST00000593655 555 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MAGI1-IT1-201ENST00000460754 2567 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 STON2-201ENST00000267540 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 DLG1-202ENST00000357674 4931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ULBP1-201ENST00000229708 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 COPS4-201ENST00000264389 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 KIF23-203ENST00000395392 3357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ZNF778-207ENST00000620195 11031 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 DDX3Y-202ENST00000360160 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 COL24A1-201ENST00000370571 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
MKRN3Q13064 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SLFN12L-202ENST00000361112 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 VMA21-201ENST00000330374 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC245014.1-201ENST00000427732 381 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
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MKRN3Q13064 ZBTB20-AS4-201ENST00000472323 675 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MRPL40P1-201ENST00000542687 604 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC092868.1-201ENST00000557949 802 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 ANKFN1-202ENST00000566473 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 SCIMP-204ENST00000574297 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MUC1-221ENST00000610359 1101 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.195-201ENST00000612667 287 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
MKRN3Q13064 MUC1-227ENST00000615517 951 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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