Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
EPHB4P54760 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms